Древний штамм поможет создать новый антибиотик

На кафедре эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии СЗГМУ им. И.И. Мечникова уже два года полным ходом идут уникальные микробиологические исследования палеонтологических образцов. Ученые уже добились определенных промежуточных результатов. Руководит лабораторией и координирует работу группы доцент кафедры Артемий Евгеньевич Гончаров. Не так давно он вернулся из Якутии, и мы попросили его рассказать о том, что дает науке развитие этого направления исследований.

 

 - Артемий Евгеньевич, что Вас сподвигло на поездку в Якутию, и что предшествовало обращению к такому роду исследований?

 -  Если говорить в общем, то привела меня к этой теме, конечно, эпидемиология. Наша кафедра уже давно сотрудничает с Северо-Восточным федеральным университетом. Два года назад я был в командировке в Якутии в связи с совместной работой, связанной с внутрибольничными инфекциями на Крайнем Севере. В это время случилось событие, мимо которого не мог бы пройти ни один ученый. Дело в том, что в Якутии, наконец, была открыта для исследований одна из последних находок мамонта. И мне было сделано предложение, от которого невозможно отказаться. Очевидно, что первобытные люди заражались инфекциями от животных, на которых охотились, поэтому исследования микробиоты ископаемых останков этих животных чрезвычайно важны для понимания  происхождения возбудителей современных инфекционных заболеваний.

 

 - Что за зверь оказался под Вашим пристальным вниманием?

 - В Якутии обнаружены значительная часть всех известных в мире уникальных находок мамонтов, шерстистых носорогов, бизонов, овцебыков, пещерных львов и других животных давно минувшей эпохи. Костные останки мамонтов на территории Якутии, как и на территории всей России, находили издавна – это порядка 80 % всех находок останков мамонтов и других ископаемых животных с сохранившимися мягкими тканями в мире. «Мой» мамонт был обнаружен экспедицией института прикладной экологии Севера СВФУ в 2013г. на острове Малый Ляховский Новосибирского архипелага в море Лаптевых. Малоляховского мамонта отличает редкая сохранность мягких тканей и наличие в туше крови. По оценкам ученых-палеонтологов, мамонт погиб приблизительно 28 тысяч лет назад. Информацией заинтересовался руководитель корейского фонда Sooam Biotech Хванг У Сок (Hwang Woo-suk). Клетки малоляховского мамонта начали  изучать  в рамках совместного проекта СВФУ и южнокорейского фонда биотехнологических исследований SOOAM . К работе подключились ученые разных специальностей из России, Кореи, Голландии, Молдавии, Франции, США. Материал для исследований удалось взять и мне.

 

 - В какой стадии сейчас находятся Ваши исследования?

 - Наши микробиологические исследования сводятся к поиску живых микроорганизмов и изучению их биологических и генетических свойств. Уже сделан ряд находок. Удалось выделить несколько штаммов микроорганизмов и получить информацию об их геномах.

В частности, мы нашли грамположительные бактерии, родственные современным штаммам энтерококка. Есть шанс проследить, как эволюционировали возбудители энтерококковых инфекций, детально изучить геномы этих видов. Предстоит многое описать, мы в начале пути.

Кроме того, выделенные штаммы изучаются на предмет возможности использования их продуктов  в качестве биологически активных веществ, действие которых которые сродни действию антибиотиков. Предварительные результаты – это возможно. Один из штаммов обладает антагонистическими свойствами, он, как показали наши коллеги из Института экспериментальной медицины, угнетает рост грамположительных бактерий – стрептококков и листерий.

 

 - А с чем Вы вернулись из Якутии совсем недавно?

 - С новым интересным материалом для исследований. Летом экспедицией Российского географического общества была сделана новая находка доисторической собаки, которая погибла 12,5 тысяч лет назад. Хотя, идут споры - может, это волк, а не собака. Процесс одомашнивания животных шел неравномерно, так что считать собакой находку можно условно. В пользу собаки говорит то, что найдена она недалеко от стоянки первобытного человека. Речь идет о знаменитой Верхоянской стоянке. Это трехмесячный щенок, погибший не своей смертью. Его, вероятно, завалило оползнем, так как для этих животных характерно рыть норы в склонах оврагов и берегов рек. Смерть была мгновенной, а так как там вечная мерзлота, у щенка прекрасно сохранился мозг, мягкие ткани и органы, так что рассчитываем подробно исследовать микроорганизмы в пищеварительном тракте.

 

 - Хорошие находки редкость?

 - Я думаю, в перспективе их будет  больше. Это связано и с потеплением, и с закрытием производств на Крайнем Севере. Коренное население занимается активным поиском бивней. Проблема лишь в том, чтобы сохранить останки. С поисковиками ведется работа, есть информаторы, но зачастую, чтобы скорее добыть бивни, в ход пускают горячую воду, которая разрушает ткани. Так что, будем надеяться, что самые интересные находки еще впереди.

 

 - Насколько мне известно, корейская группа ставит своей целью клонировать доисторических животных. Многие эксперты относятся к этой идее с изрядной долей скепсиса. А что думаете Вы по этому поводу?

 - Я понимаю, что в ближайшие годы эта задача решена не будет, но считаю, что это вполне реально в более отдаленном будущем. Науке нужны фантастические идеи. Иначе, зачем изучать космос, строить коллайдер… Такие идеи своего рода драйвер для науки. Ведь еще совсем недавно не верили, что удастся расшифровать геном человека, а сегодня достижения генетики уже вовсю используются в практической медицине.